Генетические маркеры молочной продуктивности крупного рогатого скота

3.1 Частоты встречаемости аллелей и генотипов по гену BoLA-DRB3.2 в исследуемом стаде

По гену BoLA-DRB3.2 было прогенотипировано 115 коров черно - пестрой голштинской породы.

Распределение генотипов представлено в таблице 3.

Таблица 3 ? Частота встречаемости генотипов по локусу BoLA DRB 3

Генотип BoLA DRB3	Коровы (n=115)
	Кол-во животных данного генотипа	% животных данного генотипа
(Ч/Ч)	30	26,1
(Ч/У)	30	26,1
(Ч/Н)	30	26,1
(У/У)	5	4.3
(Н/Н)	10	8,7
(Н/У)	10	8,7

Из таблицы 3 видно, что наиболее многочисленными оказались группы животных, относящиеся к (Ч/Ч), (Ч/У) и (Ч/Н) генотипам, т.е. генотипам, в состав которых обязательно входят чувствительные аллели.

Соответственно в распределении аллелей гена BoLA DRB 3.2 наблюдается смещение в сторону чувствительных (Ч) аллелей - 52,2% (таблица 4).

Подсчет частот встречаемости аллелей проводился по формуле:

P(A) = (2+)/2n, (1)

где P - частота встречаемости аллели; А - аллель; N₁- число гомозигот по исследуемому аллелю; N₂- число гетерозигот; n - объем выборки.

Таблица 4 ? Частота встречаемости аллелей по локусу BoLA DRB 3

Частота встречаемости аллелей, N=115	Процент аллеля, %	Количество носителей	Процент носителей аллеля, %
Н	26,1	50	43,5
Ч	52,2	90	78,3
У	21,7	45	39,2

На сегодняшний день известно 54 аллели гена BoLA DRB3.2, из них три аллели (*11, *23, *28) имеют статус устойчивых (У), четыре (*8, *16, *22, *24) - чувствительных (Ч), а остальные сорок семь аллелей относятся к нейтральным по отношению к лейкозу КРС. Таким образом, теоретически аллели должны иметь следующие частоты встречаемости: (У) - 5,6 %, (Ч) - 7,4 %, (Н) - 87,0 %. Но мы наблюдаем совершенно иное распределение в исследуемом стаде - смещение в сторону Ч - аллелей и элиминацию 60 % Н - аллелей. При сопоставлении эмпирических частот с ожидаемыми мы можем установить достоверность или случайность наблюдаемого между ними расхождения с помощью критерия І, предложенного К. Пирсоном в 1900 г.

(p - pґ)І

І = ? ---- (2)

pґ

Этот критерий представляет сумму квадратов отклонений эмпирических частот (p) от частот ожидаемых (pґ), отнесенную к ожидаемым частотам (pґ) (формула 2) [Лакин, 1980] (таблица 5).

Таблица 5 ? Расчет критерия І в исследуемом стаде

Аллели	Частоты	(p- pґ)	(p - pґ)І	(p - pґ)І/ pґ	І
	эмпирические (p)	ожидаемые (pґ)
Н	26,1	87,0	-60,9	3708,81	42,63	360,13
Ч	52,2	7,4	44,8	2007,04	271,22
У	21,7	5,6	16,1	259,21	46,28

Таблица 6 ? Частоты встречаемости отдельных аллелей BoLA DRB3 в стаде и исследуемой выборки

Статус аллели по отношению к лейкозу КРС	Аллель BoLA DRB3	Частота встречаемости аллелей в выборке (N=115)
		%	носителей, N
Ч	8	6,2	13
	16	17,1	31
	22	15,8	32
	24	13,6	29
У	11	6,5	15
	23	14,5	29
	28	0,9	2
	3	3,0	7
	7	0,9	2
	9	0,4	1
	10	6,9	15
	12	3,9	7
	13	0,4	1
Н	14	0,4	1
	15	0,9	2
	18	0,4	1
	25	5,2	11
	26	0,9	2
	27	2,1	4

В нашем случае фактически полученная величина І равна 360,13, что во много раз превышает критическое значение І = 5,99, для 5 % - го (Р = 0,05) уровня значимости. Таким образом, нулевая гипотеза, т.е. предположение о том, что расхождение между эмпирическими и ожидаемыми частотами носит случайный характер, опровергается. Это говорит о том, что в результате искусственного отбора действовали довлеющие факторы, которые и привели к такому резкому смещению генного равновесия в сторону чувствительных аллелей.

Из 54 известных аллелей гена BoLA DRB3 в исследуемом стаде (N=115) было обнаружено девятнадцать аллелей. Причем известные на сегодняшний день чувствительные (BoLA DRB3*8, 16, 22, 24) и устойчивые (BoLA DRB3*11, 23, 28) аллели все встретились в исследуемом стаде, а нейтральные аллели встретились частично. Из таблицы 3 видно, что самыми распространенными из чувствительных аллелей являются BoLA DRB3*22 (15,8 %),*16 (17,1 %) и *24 (13,6 %), из устойчивых - *23 (14,5 %), из нейтральных - *3 (3,0 %), *10 (6,9 %), *25 (5,2 %).

Содержание